La Mar Chiquita es el epicentro de una cuenca endorréica cuyos principales afluentes son los ríos Dulce (también conocido, según la zona, como Salí, Míshqui Mâyu y Petri), río Primero o Suquía y río Segundo o Xanaes. El río Dulce aporta sus caudales desde el noroeste y los ríos Primero y Segundo lo hacen desde el suroeste.
Llancanelo es un inmenso cuerpo de agua salada que se encuentra en el extremo sur de la Depresión de los Huarpes, en un ambiente semi-desértico. Es una cuenca cerrada (endorreica), y su extensión máxima ocupa una superficie de 65.000 hectáreas, con 120 kilómetros de perímetro, resultando una imágen contrastante con el desierto que la rodea. El azul del agua disputa la primació del colorido a los pardos y ocres característicos de los ambientes áridos, teniendo la inmensidad de la cordillera como distante complemento para un paisaje admirable y dificil de olvidar.